Soltanto lo scorso gennaio Pannella si è rivolto con parole durissime al capo dello Stato Sergio Mattarella, reo di non aver toccato nel messaggio di fine anno il tema della giustizia. Storico l'impegno dei radicali sulla questione dei diritti umani dei detenuti, contro la pena capitale, il carcere duro, il sovraffollamento degli istituti di pena. Il Partito radicale transazionale, con l'associazione Nessuno Tocchi Caino e e il contributo di Amnesty International e della Comunità di Sant'Egidio, sono i promotori della moratoria alle Nazioni Unite della pena di morte per provocare la sospensione dell'applicazione della pena di morte in tutti i paesi membri dell'Onu. La moratoria è stata ratificata dall'Assemblea generale il 18 dicembre 2007.