Il partner industriale viene individuato nell’olandese Klm, con cui Alitalia stipula due accordi di collaborazione (per area passeggeri e cargo) in vista di una possibile fusione. Ma i contrasti sul futuro hub nazionale, che Klm vuole a Malpensa e non a Fiumicino, inducono gli olandesi a una rottura unilaterale con il famoso e durissimo comunicato stampa del 28 aprile 2000, in cui si accusa il Governo italiano di essere il principale responsabile del “divorzio”. L’anno dopo Air France entra in Alitalia con uno scambio azionario del 2%, ma l’attentato dell’11 settembre 2001 avvia un periodo nero per l’aviazione civile mondiale, con Alitalia che si trova anche a fronteggiare la sempre più dura concorrenza delle low cost.